به گزارش مشرق، کانال تلگرامی مرکز اسناد انقلاب اسلامی نوشت: رهبران نهضت اسلامی علاوه بر روابط دیرینه و صمیمی که با یکدیگر داشتند، ارتباط تشکیلاتی آنها در دوران مبارزه بر نزدیکی اندیشه و افکار آنها تأثیر بسزایی داشت. از جمله میتوان به ارتباط شهید بهشتی با آیتالله سیدعلی خامنهای در مشهد اشاره کرد که در طول دوران نهضت امام خمینی استمرار داشت، بطوری که این مسئله مورد توجه مأموران امنیتی رژیم پهلوی نیز قرار گرفت.
در یکی از این اسناد که متعلق به سال 1352 است گزارشگر ساواک با اشاره به سفر شهید بهشتی به مشهد در گزارشی درباره دیدگاه او نسبت به آیتالله خامنهای مینویسد:
« یادشده ضمن تعریف و تمجید از [آیتالله] خامنهای اظهار امیدواری نموده که در آینده [آیتالله] خامنهای یکی از علماء موجه ملی و بانفوذ خواهد شد. ضمناً نامبرده روز 52/5/16 با اتومبیل شخصی به اتفاق خانوادهاش مشهد را به قصد تهران ترک کرده است.
نظریه شنبه - دکتر سید محمد بهشتی در مشهد با سیدعلی خامنهای رابطه بسیار نزدیک داشت و از افکار او بسیار تمجید و تحسین میکرد.»